„Polskie Parki Narodowe” to cykl stałych ekspozycji przyrodniczych, prezentujących pięć najcenniejszych obszarów chronionych w Polsce: Białowieski, Tatrzański, Karkonoski, Słowiński i Biebrzański Park Narodowy. W realistycznych dioramach odtworzono charakterystyczne krajobrazy i faunę każdego z nich, tworząc niezwykłą opowieść o różnorodności polskiej przyrody. Ekspozycję otwiera słynny żubr „Popiwko” – symbol ochrony gatunkowej i Białowieży, pierwszego polskiego parku narodowego. W kolejnych scenach można zobaczyć m.in. wilka w pierwotnym lesie, kozicę i świstaka w Tatrach, muflona w Karkonoszach, morświna i fokę szarą na nadmorskim brzegu czy ptaki brodzące nad rozlewiskami Biebrzy. Wystawa łączy walory edukacyjne z artystyczną oprawą i jest częścią modernizacji przyrodniczych ekspozycji Muzeum, prowadzonej od 2008 roku.