Wystawa „Apteka Tadeusza Pankiewicza w getcie krakowskim”, mieszcząca się w oryginalnych pomieszczeniach dawnej Apteki pod Orłem, upamiętnia Holokaust krakowskich Żydów oraz odwagę jej właściciela – Tadeusza Pankiewicza, Sprawiedliwego wśród Narodów Świata. Ekspozycja oparta jest na jego wspomnieniach i ukazuje aptekę jako miejsce pomocy, spotkań i schronienia w czasie Zagłady. Zwiedzający przemierzają odtworzone wnętrza – izbę ekspedycyjną, laboratorium czy pokój dyżurny – odkrywając ukrytą w meblach i dokumentach historię okupacyjnego Krakowa. Wystawa łączy rekonstrukcję wnętrz z oryginalnymi przedmiotami, fotografiami i multimedialnymi relacjami świadków. To nie tylko muzeum pamięci, ale też ważny punkt Trasy Pamięci 1939–1956, odwiedzany przez tysiące osób z całego świata.